本学の歴史は、昭和5年（1930）に設立された「昭和女子薬学専門学校」に始まります。戦災による校舎の焼失をはじめ幾多の試練に見舞われましたが、学生、教員、父母らが一致協力して学園を盛り上げてきたことが、今日の礎となっています。
平成2年（1990）、本学は世田谷キャンパスから、町田キャンパスへ移転。豊かな自然と最新の施設が調和した新キャンパスは、薬学の教育・研究に理想的な環境を提供しています。
平成18年（2006）、薬学教育制度を変革する薬学6年制がスタートしました。本学は、医科大学との提携、新棟建設をはじめ、6年制に対応した教育体制と施設の充実を図り、21世紀の医療に貢献できる薬剤師の育成をめざしています。
| 昭和5年 （1930） | 本学の前身、昭和女子薬学専門学校設立 |
|---|---|
| 昭和20年（1945） | 戦災で校舎（目黒）を焼失し、世田谷の旧陸軍衛生材料本廠舎跡に移転 |
| 昭和24年（1949） | 昭和女子薬科大学の設置認可を得て、新制大学として発足 |
| 昭和25年（1950） | 昭和薬科大学と名称を改め、男女共学となる |
| 昭和30年（1955） | 世田谷校舎を鉄筋コンクリートに改築、実習棟、図書館、体育館などの諸設備を整備 |
| 昭和40年（1965） | 長野県白樺湖畔に諏訪校舎（合宿教育施設）を設置 薬学科に加え、生物薬学科を増設 |
| 昭和44年（1969） | 大学院薬学研究科（修士課程）を設置 |
| 昭和60年（1985） | 町田校地造成開始 |
| 平成2年 （1990） | 町田キャンパス開校、移転 |
| 平成3年 （1991） | 大学院薬学研究科（博士課程）を設置 |
| 平成9年 （1997） | 学内情報ネットワーク「Shoyaku-net」を構築 |
| 平成10年（1998） | 大学院薬学研究科（修士課程）に医療薬学専攻を併設 |
| 平成12年（2000） | 創立70周年 |
| 平成13年（2001） | ネパール国ポカラ大学と学術交流の協定を締結 |
| 平成15年（2003） | 聖マリアンナ医科大学と「教育・研究の交流に関する協定」を締結 |
| 平成17年（2005） | 南カリフォルニア大学薬学部と学術協定を締結 収容定員の増加に係わる学則の変更（6年制）認可 |
| 平成18年（2006） | 6年制教育開始 |
| 平成19年（2007） | 実習棟に調剤・製剤室、無菌製剤室が完成 |
| 平成20年（2008） | 聖マリアンナ医科大学に本学学生の実習教育施設が完成 |
| 平成21年（2009） | 第2講義棟竣工 |
| 平成22年（2010） | 創立80周年、各種記念行事・記念事業を挙行 大学院薬学研究科（修士課程）薬科学専攻を設置 |
